北京實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀應(yīng)用
發(fā)布時(shí)間：2025-01-11 01:00:33
北京實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀應(yīng)用
大部分分子診斷實(shí)驗(yàn)室的核心技術(shù)都主要集中在檢測(cè)特異性、相對(duì)較短的DNA或RNA片段上。該技術(shù)能診斷傳染性疾病、鑒別影響藥物代謝的特殊基因變異型或檢測(cè)與疾病有關(guān)的基因，如與癌癥有關(guān)的基因。這些檢測(cè)的核心是實(shí)時(shí)定量聚合酶鏈反應(yīng)（PCR）、轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)擴(kuò)增（TMA）、靶向擴(kuò)增和信號(hào)擴(kuò)增等類(lèi)似技術(shù)的應(yīng)用。桑格排序和DNA片段分析或采用毛細(xì)電泳法的凝膠法都是分子診斷實(shí)驗(yàn)室的關(guān)鍵技術(shù)，但他們通常還包括檢測(cè)過(guò)程中的擴(kuò)增步驟。為了能順利應(yīng)用那些采用DNA和RNA來(lái)診斷疾病的檢測(cè)，分子診斷實(shí)驗(yàn)室須要使用定義明確的工作流程，從而得到穩(wěn)定的、有效的結(jié)果，而當(dāng)前已存在能幫助診斷實(shí)驗(yàn)室實(shí)現(xiàn)每個(gè)工作流程流水化的特殊工具。
北京實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀應(yīng)用
熱啟動(dòng)Taq酶的產(chǎn)生：在PCR的反應(yīng)過(guò)程中，主要有三個(gè)階段：變性、復(fù)性、延伸。Taq DNA聚合酶的復(fù)性溫度是72℃，但其在低溫下也有活性（活性較弱），也能催化引物與模板復(fù)性，只是錯(cuò)配率高，發(fā)生非特異性復(fù)性機(jī)率大。這樣在未達(dá)到72℃之前，反應(yīng)在Taq酶聚合下不斷擴(kuò)增出非特異性產(chǎn)物，而使實(shí)驗(yàn)失敗。在傳統(tǒng)的PCR反應(yīng)中，這樣由低溫上升至高溫的過(guò)程中，引物錯(cuò)配和二聚體的形成機(jī)率非常高，Hot Start Taq DNA聚合酶就是讓PCR反應(yīng)一開(kāi)始就在大于70℃下進(jìn)行。當(dāng)溫度較低時(shí)，酶活性被封閉，當(dāng)溫度大于一定溫度時(shí)酶又開(kāi)始工作。這樣就避免了在低溫下復(fù)性、延伸的過(guò)程，消除引物錯(cuò)配和二聚體形成，減少非特異性產(chǎn)物的產(chǎn)生。我們是如何對(duì)Hotstart Taq酶修飾而讓它只在高溫下才能發(fā)揮活性？這就是Hot Start taq酶的作用原理。
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加強(qiáng)技術(shù)指導(dǎo)。中國(guó)動(dòng)物疫病預(yù)防控制中 心要制定國(guó)家動(dòng)物疫病強(qiáng)制免疫技術(shù)指南，組織開(kāi)展省級(jí)免疫技術(shù)師資培訓(xùn)。國(guó)家獸醫(yī)參考實(shí)驗(yàn)室、專(zhuān)業(yè)實(shí)驗(yàn)室、區(qū)域?qū)嶒?yàn)室和各省份動(dòng)物疫病預(yù)防控制中 心要持續(xù)跟蹤病原變化和流行趨勢(shì)，為各地免疫方案的制定、疫苗的選擇和更新提供技術(shù)支撐。各省份要組織做好鄉(xiāng)鎮(zhèn)動(dòng)物防疫機(jī)構(gòu)、村級(jí)防疫員及社會(huì)化服務(wù)組織的免疫技術(shù)培訓(xùn)。疫苗及診斷試劑供應(yīng)企業(yè)要做好培訓(xùn)、技術(shù)服務(wù)等工作。
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常規(guī)普通PCR常見(jiàn)問(wèn)題：1. 優(yōu)化反應(yīng)條件，梯度摸索退火溫度，延長(zhǎng)退火延伸時(shí)間，增加反應(yīng)循環(huán)數(shù)（30-45區(qū)間為宜）。2. 對(duì)核酸模板進(jìn)行純化，或使用商業(yè)化核酸提取試劑盒進(jìn)行提取，增加核酸模板的上樣量。3. 優(yōu)化反應(yīng)體系（預(yù)混體系除外），改變檢測(cè)體系中的Mg2+濃度及dNTPs用量，更換體系中Buffer。4. 重新設(shè)計(jì)引物，避免引物二聚體和鏈內(nèi)二級(jí)結(jié)構(gòu)，在一次稀釋引物后可分裝成多支小管，減少反復(fù)凍融次數(shù)。
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選擇靈敏度高的熱啟動(dòng)Taq酶。一般說(shuō)，Taq酶的擴(kuò)增效率高，靈敏度就高，但也有不一致的情況。如果要擴(kuò)增的樣本目標(biāo)基因豐度較低，建議對(duì)Taq酶的擴(kuò)增靈敏度進(jìn)行檢測(cè)。常見(jiàn)的檢測(cè)方法是將目標(biāo)基因質(zhì)粒片段進(jìn)行10倍或5倍梯度稀釋?zhuān)谳^低的幾個(gè)稀釋度進(jìn)行PCR檢測(cè)，選擇檢測(cè)靈敏度較高的熱啟動(dòng)Taq酶。目前國(guó)內(nèi)市場(chǎng)上常用的ABI、Bioline、Biog的擴(kuò)增靈敏度都比較高，但知名品牌T的靈敏度略低，研究者可根據(jù)自身的實(shí)驗(yàn)要求進(jìn)行選擇。
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PCR產(chǎn)品占據(jù)分子診斷的主要市場(chǎng)，基因芯片是分子診斷市場(chǎng)發(fā)展的主要趨勢(shì)。PCR產(chǎn)品靈敏度高、特異性強(qiáng)、診斷窗口期短，可進(jìn)行定性、定量檢測(cè)，可廣泛用于肝炎、性病、肺感染性疾病、優(yōu)生優(yōu)育、遺傳病基因、腫瘤等，填補(bǔ)了早期免疫檢測(cè)窗口期的檢測(cè)空白，為早期診斷、早期治療、安 全用血提供了有效的幫助?；蛐酒欠肿由飳W(xué)、微電子、計(jì)算機(jī)等多學(xué)科結(jié)合的結(jié)晶，綜合了多種現(xiàn)代高精尖技術(shù)，被專(zhuān)家譽(yù)為診斷行業(yè)產(chǎn)品。但其成本高、開(kāi)發(fā)難度大，產(chǎn)品種類(lèi)很少，只用于科研和藥物篩選等用途。