實(shí)時熒光定量PCR (qPCR)實(shí)驗(yàn)操作流程
實(shí)驗(yàn)原理:
實(shí)時熒光定量聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)指的是在PCR進(jìn)行的同時,對其過程進(jìn)行監(jiān)測的能力(即實(shí)時)。
因此,數(shù)據(jù)可在PCR擴(kuò)增過程中,而非PCR結(jié)束之后,進(jìn)行收集。這為基于PCR的DNA和RNA定量方法帶來了革命性的變革。在實(shí)時熒光定量PCR (qPCR)中,反應(yīng)以循環(huán)中首 次檢測到目標(biāo)擴(kuò)增的時間點(diǎn)為特征,而非在一定循環(huán)數(shù)后目標(biāo)分子累計(jì)的擴(kuò)增量。目標(biāo)核酸的起始拷貝數(shù)越高,則會越快觀察到熒光的顯著增加。相反,終點(diǎn)法檢測(也稱“讀板檢測”)測量的是PCR循環(huán)結(jié)束時累計(jì)的PCR產(chǎn)物量。
實(shí)驗(yàn)準(zhǔn)備:
cDNA模板、引物、qPCR mix、ddH2O等。
實(shí)驗(yàn)步驟:
1.配樣
按照實(shí)驗(yàn)需要對cDNA模板加水作適當(dāng)稀釋,渦旋混勻后離心,根據(jù)實(shí)際所檢測樣品和基因的數(shù)量計(jì)算加樣體系,按照體系以此加入ddH2O,qPCR mix,引物,配成一管mix,渦旋混勻,后離心。準(zhǔn)備適量的qPCR八連排板或者96孔板,在這里我們用的是八連排管,置于冰上操作,將上步混勻的mix按每孔19μL加入到八連排孔中。
2.加模板
在每個孔各加入1μL的cDNA模板。加樣完畢后,蓋上八連排管蓋,注意盡量從孔邊上壓緊管蓋。渦旋混勻后離心,去除氣泡。
3.上機(jī)反應(yīng)
上機(jī)前先設(shè)置程序,具體如下:設(shè)置反應(yīng)溫度,設(shè)置孔板信息,樣品放入儀器中,開始反應(yīng)。
4.導(dǎo)出數(shù)據(jù)
反應(yīng)結(jié)束后得到qPCR數(shù)據(jù),根據(jù)溶解曲線,查看數(shù)據(jù)的有效性,導(dǎo)出數(shù)據(jù)為EXCEL文件并保存。
5.實(shí)驗(yàn)結(jié)束
實(shí)驗(yàn)完畢,打開qPCR儀,取出八連排管,蓋上qPCR儀,關(guān)閉電腦,儀器。
注意事項(xiàng):
1.由于分裝過程中,吸頭具有表面張力,會導(dǎo)致樣品損耗,因此根據(jù)實(shí)際需要,多配一些。
2.實(shí)驗(yàn)中用移液槍時注意保持相同的力度。勻速吸打。
3.操作應(yīng)于冰上進(jìn)行,防止因操作時間過長,影響酶活性。
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